十二指肠溃疡患者的迷走神经功能呈亢奋状态，胃酸分泌增加，此时应用促胃肠动力药，不仅于病无益，反而使大量食物快速进入十二指肠，刺激十二指肠大量分泌胃泌素，造成胃酸大量增加，使原本单纯的十二指肠溃疡又并发胃溃疡，成了复合性溃疡，更增加了治疗难度。
如何治疗两种溃疡当某一患者确诊为消化性溃疡后，不要急于将三联或四联疗法不加选择地应用，而应进一步细化为胃溃疡或十二指肠溃疡。对于胃酸增多者应予以质子泵抑制剂为主的三联疗法，要充分考虑到精神因素对胃酸分泌的促进作用，可适量配伍镇静药，如安定、多虑平等。
十二指肠溃疡的主要发病机制是侵袭因素的增强，所以要想提高疗效，缩短疗程，抗胆碱能药物的使用必不可少，如颠茄、山莨菪碱等。尽管有一定副作用，但药物停用后副作用即消失，不会对躯体造成大的或不可逆转的损害。
