因为要消化过量的蛋白质，而自我们骨骼中流失的钙，在血液中发挥了它的功用后，一定要被排到某个地方我们所摄取的，但因磷钙比例太高而无法被利用吸收的钙也是如此，这些钙最后都被排到尿液里，使肾脏系统里的钙含量很高而经常成为结晶石。
这就是为什么这种在急诊病例中最痛苦的肾结石，发生在肉食者中的几率远比素食者来得高。
另外，有很多的证据指出，过量的蛋白质与肾脏纤维的破坏及肾功能的退化有关。多余的蛋白质并不是慢慢随尿液流出体外而已，肾脏必须很辛苦工作才能将之排出。
很多用动物做的实验显示，饮食中的蛋白质越高，肾发炎及肿大的几率越大，病情也越严重。如果人类过度摄取蛋白质，我们的肾脏也会有同样的问题。
肾曾受损过或失去一个肾的人，通常都可以用限制蛋白质含量的饮食来确保另一个肾的功能。肾有毛病的人若没有限制蛋白质的摄取，尤其是那些继续吃肉的人，他们的肾通常会很快恶化到依赖洗肾机的地步。
很重要而且必须强调的一点是，肾疾病与过量蛋白质的关联，就如同骨质疏松症与过量蛋白质的关联一样，在有知见的医学界已不再仅仅被考虑为可能而已，太多的研究员在太多不同的情况下做了太多的测验，而结果又太一致，现在是被肯定了。
