幽门螺杆菌在全球自然人群的感染率超过50%,全球各地差异甚大,发展中国家高于发达国家，经济越落后,文化水平越低,幽门螺杆菌感染率越高。幽门螺杆菌感染率随着年龄增加而增加。对正常人群的大量血清流行病学调查资料显示，幽门螺杆菌感染率随年龄上升的模式有两大类。第一类为儿童期易感型，儿童期为感染率剧增期，每年以3%~10%甚至更高的速度急剧上升，至10岁有40%~60%以上的人受感染，以后感染速度减慢，每年以0.5%~1%速度缓增，至50岁左右感染率基本上不增，进入平坦期，到70岁以上由于免疫功能下降，血清法检测可见阳性率下降，但不代表感染率真正下降，发展中国家包括我国属这一类型。第二类为感染均衡型，感染率随年龄增加的速度在儿童和成年期基本一致，以每年0.5%~1%速度上升，有些地区50岁以后感染率非但不进入平坦期，而且还明显增高，这代人在儿童期受感染，把高感染率带到现在，发达国家属这一类型。
分子生物学流行病学调查显示在幽门螺杆菌感染后还可有幽门螺杆菌不同菌株的重复感染。幽门螺杆菌二重感染率总的来说不高，在不同地区和人群差别较大。近年利用幽门螺杆菌的基因多态性进行菌株分布的流行病学调查的报告很多，主要用caga致病岛和vaca基因。vaca基因又有三个信号区（s1a、s1b、s2）和两个中区（m1、m2）,构成不同的基因亚型。各型菌株毒力不同，caga（+）型毒力较强。vaca型中s1/m1型毒力强，s1/m2低，s2/m2无毒性。caga（+）型在世界各地特别是我国和东南亚占大多数，在消化性溃疡（pud）、胃癌、功能性消化不良（fd）病人中比“健康”对照显著高。vaca亚型分布北欧和东欧s1a型为主。北美及中南欧s1a和s1b大致相等，中南美s1b为主，日本s1a为主，而m1和m2世界各地分布大致相同。我国上海和s1a/m2为主，西安s1a/m1为主。
