慢性肾盂肾炎较早期肾浓缩功能障碍而gfr相对保存完好。由于一开始细菌在髓质繁殖引起广泛的炎症反应最终出现瘢痕肾小管结构扭曲，从而干扰髓质转运机制。这些变化可引起多尿夜尿肾性尿崩症和电解质穿孔病变累及皮质，有广泛的瘢痕形成时导致肾衰
易复发是慢性肾盂肾炎的症状的临床特点再次发作可以是原病复发或是重新感染两者性质不同，且处理与预后各异，必须区分复发是指肾盂肾炎未治愈只是病情暂时缓解在某些因素促发下，潜伏的细菌又引起炎症而发病。重新感染则是原病已愈，细菌已灭，由新的致病菌入侵所致。
静脉肾盂造影示肾盂肾盏变形缩窄双肾形态学检查（b超ct等）显示肾影不规则甚至缩小。肾小管功能有持续性损害如尿渗透压降低尿视黄醇结合蛋白及尿β2微球蛋白升高部分病人有易感因素存在如尿路梗阻畸形肾下垂及膀胱-输尿管反流等
老年人的慢性肾盂肾炎的症状多不典型，常复杂多样。重者急性发病时可表现为与急性肾盂肾炎相似的症候群。可有明显的全身感染症状较常见的症状有全身不适、体重减轻低热、尿失禁排尿困难、尿潴留多尿夜尿等。
