尿石症的主要病因为钙磷代谢紊乱以及其他因素。而患者对代谢紊乱方面比较关心。虽然尿结石的形成与代谢紊乱两者之间的关系仍无最终结论，但是经过医学科研人员多年的研究认为钙（钙食品）磷代谢紊乱可引发高钙尿、高草酸尿、高尿酸尿、胱氨酸尿、黄嘌呤尿、低枸橼酸尿等。
此外，患者因某种病而大量服用维生素d、维生素c、皮质激素、氨苯喋啶、四环素、阿司匹林等可引发肾结石。溃疡患者服用硅酸镁可形成硅酸盐结石。青光眼患者服用乙酰唑胺可形成磷酸钙过饱和而引发结石。服用磺胺类药物，由于乙酰衍生物由肾脏排泄，在酸性尿中溶解度低，所以导致有些患者形成结石。
尿石症病人的年龄高峰再25-40岁之间，女性有两个高峰，即25-40岁及50-65岁。出现第二个高峰可能与女性（女性食品）绝经及骨质疏松有关，2-3%的结石病发生在2-6岁的儿童（儿童食品）身上，常与尿路染、先天畸形有关。男女约为3.1-9.46/1，各地区差异较大，其中男性（男性食品）患上尿路结石约是女性的1-2倍。
多糖饮料，尤其是果茶等富含草酸的食品，可大大增加草酸结石的发病率。据统计，我国尿石症患者中草酸盐结石的患者约70%以上，因此，仅喜欢喝饮料一项，就可使许多原本可患可不患泌尿系统结石的人发病。
