主要症状是反复发作急性扁桃体炎。也有部分患者无明显急性发作史。表现为经常咽部不适，异物感，发干，痒，刺激性咳嗽，口臭等症状。儿童过度肥大的扁桃体可引起呼吸、吞咽、语言障碍。若伴有腺样体肥大可引起鼻塞、鼾声及卡他性中耳炎症状。由于经常咽下分泌物及隐窝中的细菌毒素，可致消化不良，头痛，乏力、低热等症状。
临床上为记录方便，可将扁桃体的外形大小分为ⅲ度扁桃体超出舌腭弓，但未遮盖咽腭弓者为ⅰ度。已遮盖咽腭弓者为ⅱ度。超出咽腭弓突向中线者为ⅲ度。但扁桃体的大小不能作为炎症的指征，因为儿童有生理性肥大，成人多萎缩。
