消化系统疾病是引起腰背痛的病因之一，有时甚至是首发症状，特别是腰背处骨质及软组织没有明显疾病时。一些老年人，比如得了急性胆囊炎、十二指肠球部、球后溃疡和（或）后壁穿孔、急性胰腺炎等，皆可出现急性腰背痛。腰背痛如果同时还伴有下列症状，应到消化科检查。
伴有反复发作的上腹胀痛、反酸、嗳气消化性溃疡，尤其是发生于胃、十二指肠后壁较深的溃疡。胃溃疡患者多在餐后出现疼痛。十二指肠球部溃疡患者多在空腹及夜间出现疼痛。
伴有右上腹胀痛、恶心呕吐急、慢性胆囊炎患者，进食油腻食物后易出现右腰背痛，甚至可放射至右肩部。伴有消瘦、腹泻、黄疸应警惕慢性胰腺炎和胰腺癌。胰腺疼痛常在中上腹和腰背部呈束带状，疼痛持续，程度有波动。伴有下腹胀痛、肠鸣、大便习惯改变和大便性状异常肠道疾病，如炎症性肠病、肠道肿瘤等，疼痛也可向腰背部放射。肠道疾病患者疼痛部位常常不固定。
