此外，从中医的角度来说，不同的芽菜还有不同的保健作用。绿豆芽性凉味甘，有解酒毒、热毒、肿毒的功效。香椿芽有开胃、调节人体内分泌等功能。萝卜苗性微凉，味甘，有健胃消食、止咳化痰、除燥生津等功效。荞麦芽富含芦丁，对于人体血管有扩张及强化作用，对高血压和心血管疾病患者是一种较好的保健食品。枸杞苗滋阴壮阳。黑豆芽性微凉，味甘，有活血利水、清热消肿、补肝明目的功效。
芽菜的食用方法很多，但以凉拌、涮火锅、煮汤最能体现它的幼嫩、爽口。需要注意的是，不是所有的芽菜都可生食，豆类芽菜要煮熟后才能食用，而萝卜芽生食味道更佳。
