除了重金属，猪肝往往也存在着很高的兽药残留。成都有调查发现，市售动物制品中，猪肝中兽药残留较高，虽然大多并没有超标，但是相比猪肉、牛肉等还是比较高的。总体来说，猪肝、猪心等动物内脏的毒素往往是比较多的。
此外，猪肝的胆固醇含量也很高，100克猪肝的胆固醇含量为288毫克。胆固醇摄入过高，尤其是低密度胆固醇摄入过高，会增加心血管疾病的风险。若为健康考虑，每天从食物中摄取的胆固醇含量不要超过300毫克。
虽然猪肝中丰富的维生素a对于维持视力的确有一些好处，但猪肝不是获取维生素a的唯一途径，也不是获取维生素a的最佳食物来源。因此，为了所谓的明目效果而吃大量的猪肝，并不是好的选择。
