低血糖与血酮过高在生酮饮食开始期间属于常见的副作用，在开展的10例患儿中有2例出现过低血糖或者血酮过高的情况，比例在20%左右。在住院期间会密切监测血糖血酮，如果血糖值低于2.2、血酮值高于6就必须要采取措施，给孩子喝20~30毫升橘子汁或者50%的葡萄糖溶液，半小时后再监测一次血酮血糖，如无改善继续服用橘子汁或者葡萄糖。通过仪器监测是一种方法，除此之外家长还要密切关注孩子的临床症状，如果出现脸色发白、嘴唇发白、盗汗就是低血糖的表现；如果出现脸发红、呼吸急促、心跳过快呼吸有烂苹果气味的话就是血酮过高的情况，这两种情况都必须立刻给予橘子汁或者葡萄糖。低血糖或者血酮过高的处理方法比较简单，家长无需紧张，密切关注孩子的情况即可。
