1．针对病因的措施
麦类过敏所致的腹泻根本的治疗是停用所有含麦类的食品。初期应给与含果糖与葡萄糖的食物及脱脂牛奶。待病情好转逐渐增加蛋白质食品，如豆浆、瘦牛肉、鱼、鸡肉等。以后酌情增加淀粉及脂肪食品。如再次发生消化不良症状及腹泻，立即恢复初期食品。
糖不耐受所致腹泻需从食物中去除不耐受的糖。对原发性不耐受糖的患儿，需长期限制糖，但随年龄增长对碳水化合物不耐受会有所改善，此时可适当添加一些牛奶、淀粉和糖。对继发性不耐受糖的患儿，限制糖仅是暂时的，经过数周或数月后，可以逐步恢复正常饮食。
对牛奶过敏所致的腹泻应从宝宝的食物中去除牛奶。由于羊奶和马奶也有交义过敏反应，所以不能应用。如无人奶，可用豆奶、肉汤和酪蛋白水解物代替牛奶。婴儿的食品简单，可改用代乳粉喂养，同时加辅食品，如蛋黄泥、菜泥、胡萝卜汁等，以后逐渐增加固体食品即可。对牛奶过敏也会随着年龄增大过敏减少。在6个月后可给与少许牛奶以了解是否过敏，若无过敏可逐渐增加牛奶量，一般到了2岁后牛奶过敏巳很少见。
菌群失调所致的腹泻需停用所有的抗菌素及皮质激素，然后补充肠道正常菌种，以恢复肠道内微生态平衡，使正常菌种占据绝对优势。常用的有双歧杆菌、乳酸杆菌、粪链球菌等。市售的制剂有培菲康、丽珠肠乐、金双歧等。
