在研究过程中，他选取了七对成年同卵双胞胎女性，让双胞胎中的一个人每天进食两次含5种乳酸菌的市售酸奶，而另一方则不进食任何酸奶。在实验过程及开始、结束的前后4周，均定期采集大便，并针对大便中含有的肠内细菌种类、哪种基因在细菌中活性化等进行了研究，结果显示，肠内细菌的种类、其所占比例、活性化的基因种类和量的比值，在进食和未进食酸奶的双胞胎之间不存在任何差异。
小鼠实验中有少许效果
在小鼠实验中，mcnulty选取了无菌小鼠，人为地将15种只有人类有的细菌植入小鼠体内，并调查了酸奶对其活动的影响。结果显示，与人体食盐相同，肠内细菌的种类及比例与所摄入的酸奶毫无关系，但在活性化的基因这一项中，看到了微弱的差距。实验结果显示，摄入了酸奶后，分解糖的酶群中的基因出现活性化效果。
研究者认为，如果在该次实验中出现的微弱差距就是酸奶能给予肠内环境的全部效果，那么人们对于酸奶纯属过分寄予厚望。但研究者同时认为，在该次的人体研究中，只针对7对同卵双胞胎进行研究，实验对象数据太少，而小鼠实验中小鼠的肠内细菌是否能和人体一模一样，这一点也依然需要进一步探究，直接下断言还为时尚早。
