天然黄豆含胰蛋白酶抑制物质（trypsininhibitor），长久以来被认为是抗营养因子（anti-nutritionalfactor），它会影响蛋白质之吸收，但该物质经热处理即被破坏，可以使胰蛋白抑制物质变性或降低活性（但仍有些残留在食物中）。但美国国家癌症研究所于1987年发表认为蛋白抑制物质可抑制乳癌、皮肤癌、膀胱癌，原因是由于其可抑制某些会改变特定的遗传基因的活性。另外，又可抵抗辐射能与自由基，强化免疫系统，而保护dna免予受损，展现预防各种慢性疾病的潜力。
另外据文献报导黄豆含有适宜的硒（0。14～0。29mu;g/g黄豆）其抗氧化活性为维生素e的50～100倍。而此含硒的黄豆蛋白，可将有机过氧化物予以还原而抑制细胞被氧化，以对抗老化与癌症。
