但要注意有些鱼不能吃，如被工业废水和农药污染过的鱼不能吃。被污染过的鱼一般眼睛浑浊，鱼鳃粗糙暗红，甚则鱼的形态不完整，脊椎弯曲，甚至出现畸形等。鱼烧焦后会产生一种强烈的致癌物质，故烧焦的鱼不能吃。春季是河豚回游江河产子的旺发季节。河豚鱼是剧毒鱼类，它的毒素毒性相当强，比氰化物还要强1千多倍，而且这种毒素不易破坏，不时可闻因误食或贪食其鲜美肉质而丧生的事件。浅类生活在江河湖海中，会携带一些病菌或感染某些寄生虫病，所以在烧鱼时要烧熟或蒸透，否则容易被传染。现在流行的生鱼片的吃法人们要慎之又慎，千万不要为了贪图口福而祸及身体。
鱼类含有嘌呤类物质，所以痛风患者吃鱼要谨慎，因为痛风是由于人体内的嘌呤代谢发生紊乱所引起的。还有血小板减少、血友病、维生素k缺乏等出血性疾病患者亦要少吃或不吃鱼，因其易导致患者的毛细血管出血不止，从而加重症状。
