大多数通过性生活途径感染艾滋病病毒者就是这样被病毒感染的首先包皮对于性生活过程中微小的擦伤很敏感，滤过性的病菌可能通过性生活过程中形成的擦伤进入体内。在现实生活中，有些男性平时不太注意阴茎的卫生，特别是那些包皮过长和有包茎问题的人，他们包皮中的皮脂腺分泌物不能很好地排出，并逐渐形成包皮垢。包皮垢适宜细菌生长，可引起阴茎头和包皮发炎，炎症会使包皮的黏膜失去屏障作用，容易成为艾滋病病毒和其他溃疡性性传播疾病藏匿和进入体内的入口，增加直接感染艾滋病病毒的危险性。另外，包皮中有高密度的郎格汉斯细胞，这些细胞内若含有艾滋病病毒性疾病的受体，当其他病原体感染或孕酮作用等使包皮的上皮细胞屏障能力减弱或破坏时，艾滋病病毒就获得了与郎格汉斯细胞接触的机会。
在临床治疗的性病患者中，男性包皮环切术的预防作用非常明显。通过包皮环切手术可以大大改变那些原来藏在包皮中，能导致尿路感染的皮肤天然寄居微生物的生活环境，同时也可以减少艾滋病病毒侵入阴茎的能力。国外有科学家在乌干达进行过一项实验研究在对187对女性艾滋病病毒检查呈陌性反应，而其男性伴侣不是感染者的夫妇进行的跟踪调查中发现，30个月后其中50名曾经接受过包皮环切的丈夫，没有一人感染艾滋病病毒，而没有接受包皮环切的137名丈夫中，有40人感染了艾滋病病毒。因此，南非约翰内斯堡市威特沃特斯兰德大学生殖健康及hiv／艾滋病研究所的临床认为，男性包皮环切是目前最有效的预防艾滋病病毒感染的措施，对男性而言，包皮环切是一项只需15-30分钟的手术，但它对于男性的终生却能产生很深远的影响。相对而言，无论是推广安全套还是阴道灭菌剂，都需要长期地坚持和不断地努力才能有效。
