生理性因素。有些孩子晚餐吃得太多，消化不良、胃肠部胀气都会导致肠胃道蠕动紊乱，从而引起面部咀嚼肌自发性的收缩，使得牙齿来回磨动。
病理性因素。由于小儿发育不完善，胃肠道功能不够好，容易出现贲门括约肌松弛的情况，会导致胃食道返流到气管，使得小儿在睡梦中磨牙，这在早产儿中尤其常见。应该注意的是，如果3岁以上的小孩还出现胃食道返流，就可能是得了贲门松弛症，需要就医治疗。食物返流严重者，可引起哮喘、肺炎等。此外，如果孩子肚子里长有蛔虫，也会引起磨牙。蛔虫在孩子的小肠内掠夺各种营养物质，分泌毒素，上下乱窜，刺激肠管使蠕动加快，引起消化不良、脐周围隐痛，这样会使小孩在睡眠中神经兴奋性不稳定，从而引起磨牙。对于大一些的小孩，患龋齿是引起梦中磨牙的常见因素。患龋齿的孩子，牙齿排列不好，加上炎症的刺激，都会引发磨牙。此外，儿童在7至12岁是乳牙、恒牙的交替过程，如牙齿发育不好，上下牙接触时有的牙尖过高，咬面不平，也会引发夜磨牙。此外，佝偻病、神经衰弱、遗传因素等，都会引起夜磨牙。
心理因素。担心功课紧作业多，或学习不好遭父母训斥，家庭不和、父母离异等都极易造成焦虑、压抑、烦躁不安、过度紧张等不良情绪，导致儿童夜间发生磨牙现象。
