螺旋藻在市场上售价不低，但作为一种肉眼很难看到的微小的藻类植物，平常人很难辨别真伪。咨询了云南丽江绿源螺旋藻的专业人士，他们给出了具体的鉴别方式：
首先 ，查看螺旋藻的标志，正规厂家生产的螺旋藻会有三个标志：第一个，带有“qs”标志的食品“质量安全”标志，其次，具有“gmp”标志，表示在生产过程中实施对产品质量与卫生安全的自主性管理制度。最后，还有一个很重要的标志“蓝帽子”，这是国家保健食品的标志。
第二：看颜色：真正纯天然100%的螺旋藻，无论粉剂、片剂、胶囊内的藻粉都呈墨绿色，不仅要看表面，还要掰开看横截面的颜色。绿色的螺旋藻不是伪劣的就是假冒的，或者是掺杂了其他物质。由于螺旋藻很干燥，易于吸潮，吸潮后将逐渐变成绿色，而且容易腐败变质，吃了这种螺旋藻不仅无益健康，而且有害。
第三：闻气味，螺旋藻有一种特殊的藻腥味或海腥味。没有这种气味的肯定不是螺旋藻。但是带腐败腥味的很可能是伪劣产品。
