尚未完全明确，以为ra是一种自身免疫性疾病已被普遍承认。具有hla-dr4和dw4型抗原者，对外界环境前提、病毒、细菌、神经精神及内分泌因素的刺激具有较高的敏感性，当侵袭机体时，改变了hla的抗原决定簇，使具有hla的有核细胞成为免疫按捺的靶子。因为hla基因产生可携带t细胞抗原受体和免疫相关抗原的特性，当外界刺激因子被巨噬细胞识别时，便产生t细胞激活及一系列免疫介质的开释，因而产生免疫反应。
导读rf包括igg、iga、igm，在全身病变的发生上起重要作用，其中igg-rf本身兼有抗原和抗体两种结合部位，可以自身形成双体或多体。含igg的免疫复合物沉积于滑膜组织中，刺激滑膜产生igm0、iga型ra。igg-rf又可和含有igg的免疫复合物结合、其激活补体能力较单纯含igg的免疫复合物更大。rf滑膜的特征是存在若干由活性淋巴细胞、巨噬细胞和其它细胞所分泌的产物，这些细胞活性物质包括多种因子t淋巴细胞分泌出如白介素ⅱ（il-2）、il-6、粒细胞-巨噬细胞刺激因子（gm-csf）、肿瘤坏死因子a、变异生长因子β来源于激活巨噬细胞的因子包括il-1、肿瘤坏死因子a、il-6、gm-csf、巨噬细胞csf，血小板衍生的生长因子由滑膜中其它细胞（成纤维细胞和内长细胞）所分泌的活性物质包括il-1、il-6、gm-csf和巨噬细胞csf。这些细胞活性物质能说明类风湿性滑膜炎的很多特性，包括滑膜组织的炎症、滑膜的增生、软骨和骨的损害，以及ra的全身。细胞活性物质il-1和肿瘤坏死因子，能激活原位软骨细胞，产生胶原酶和蛋白分解酶破坏局部软骨。
细胞间的相互作用使b细胞和浆细胞过度激活产生大量免疫球蛋白和类风湿因子（rf）的结果，导致免疫复合物形成，并沉积在滑膜组织上，同时激活补体，产生多种过敏毒素（c3a和c5a趋化因子）。局部由单核细胞、巨噬细胞产生的因子如il-1、肿瘤坏死因子a、和白三烯b4，能刺激我形核白细胞移行进入滑膜。局部产生前列腺素e2的扩血管作用也能促进炎症细胞进入炎症部位，能吞噬免疫复合物及开释溶酶体，包括中性蛋白酶和胶原酶，破坏胶原弹力纤维，使滑膜表面及关节软骨受损。rf还可见于浸润滑膜的闪细胞，增生的淋巴滤泡及滑膜细胞内，同时也能见到igg-rf复合物，故即使感染因素不存在，仍能不断产生rf，使病变反应发生发火成为慢性炎症。
