外科开胸手术是主要治疗手段。传统的外科开胸手术治疗是主要治疗方式，它一般适用所有简单先天性心脏病及复杂先天性心脏病，例如合并肺动脉高压的先天性心脏病、法乐氏四联征以及其他有紫绀现象的心脏病。
相对于其他手术方式，开胸手术费用较低，住院时间7-10天左右，但手术创伤较其他方式大，术后恢复较慢。目前已为近12000例先心患儿进行心外科修补手术。
介入封堵的特点为创伤小适应症严格。介入封堵手术是近几年发展起来的一种新型微创治疗，它依靠齐全的设备、先进的导管室、技术熟练精湛的专科医师，主要适用于动脉导管未闭、房间隔缺损及部分室间隔缺损不合并其他需手术矫正的畸形患儿。
介入封堵治疗相对并发症少，创伤小，无须开胸手术，恢复快，患者痛苦小，住院时间3天左右，但它有较严格的适应症，费用相对外科手术要高。当然，随着医学技术的日臻成熟，介入封堵的手术适应症也会进一步扩大。
外科微创封堵的特点是外科与介入的结合。外科微创封堵术也是近两年兴起的新技术，它不需要开胸，而是在右胸前部胸骨切2-3厘米的小口，置入推送器，在心脏超声的引导下，释放封堵器将缺口堵住。平均手术时间不超过1个小时，患者手术当天就能下地活动，住院3-4天。适用于部分房间隔缺损、室间隔缺损和动脉导管未闭的患者。
