潜伏期4～21天，一般为10～14天。病毒初在单核巨噬细胞内繁殖，再释放入血，多数人在感染后并不出现症状，但血液中抗体可升高，称之隐性感染。部分人出现轻度的呼吸道症状。极少数患者，病毒通过血脑屏障造成中枢神经系统病变，出现脑炎症状。
典型患者的病程可分四个阶段
（一）初热期
病程第1～3天，体温在1～2日内升高到38～39℃，伴头痛、神情倦怠和嗜睡、恶心、呕吐。小儿可有呼吸道症状或腹泻。
（二）极期
病程第4～10天，进入极期后，突出表现为全身毒血症状及脑部损害症状。
1.高热
是乙脑必有的表现。体温高达39～40℃以上。轻者持续3～5天，一般7～10天，重者可达数周。热度越高，热程越长则病情越重。
