活组织切片检查结果往往显示，每组四个或五个肝细胞一起形成较大的细胞，虽然这些大细胞继续发挥作用，但这些大细胞的活动效率要比正常肝细胞低。这种类型的新生儿肝炎有时被称为巨细胞肝炎。
新生儿肝炎的症状类似于与另一婴儿肝病——称为胆道闭锁。然而新生儿胆道闭锁症中胆管逐步被破坏的原因我们还了解甚少。尽管一个婴儿患有胆道闭锁症的同时也伴有黄疸与肝部肿大，但还是会正常生长并且脾脏不出现炎症。除了这些症状外，肝组织活检及血液测试都需要用来区分胆道闭锁症及新生儿肝炎。
什么是新生儿肝炎并发症？
新生儿肝炎所致风疹或巨细胞病毒有可能发展一种脑感染，可能导致智力迟钝或脑瘫。这些婴儿其中的许多也将因为肝病破坏引起的永久性的肝细胞损伤，导致疤痕（肝硬化）。
多数婴儿巨细胞病毒性肝炎将会痊愈，很少或者根本没有疤痕。对肝脏来说，随着胆汁流动的改善，它的成长也会逐渐正常。然而，大约20%的婴儿因为受到肝炎的影响，将继续以发展为慢性（进行性）肝病和肝硬化。这些儿童的肝脏将会因为疤痕而变硬，而且六个月以下大的婴儿的黄疸会不消退，最终符合这些症状的婴儿将需要进行肝脏移植。
