鉴于红霉素对胃肠道刺激大，并可引起血胆红素及转氨升高，以及有耐药株产生的报道。人们开始选用大环内酯类的新产口，如罗红霉素（roxithromycin）及甲红霉素（clarithromycin）、阿奇霉素（azithromycin）等，口服易耐受、穿透组织能力强，能渗入细胞内，半衰期长，mic为0.002～0.03mg/l。近年来，在日本采用白霉素（leucomycin）治疗本病效果较好，该药无明显毒副作用，比较安全，口服量为20～40mg/（kg﹒d），分4次服用﹔静滴量为10～20mg/（kg﹒d）。
四环素类抗生素支原体感染虽有肯定疗效，但其毒副作用较多，尤其是四环素对骨骼和牙生长的影响，即使是短期用药，四环素的色素也能与新形成的骨和牙中的钙相结合，使乳牙黄染。故不宜在7岁以前儿童时期应用。
氯霉素和碘胺类因为治疗支原体感染的疗程较长，而氯霉素类、磺胺类抗菌药物毒副作用较多，不宜长时间用药，故临床上较少用于治疗支原体感染。
