如果闹铃声音较大，容易使人受到惊吓，引起血管收缩，加快心跳，诱发或加重心脏病、脑动脉硬化、心肌梗死等。刺激性铃声还会使人的神经系统变得高度紧张，可能导致消化不良、胃口不好、便秘或腹泻等。
此外，由于长期在刺激声中被惊醒，内分泌系统容易紊乱，可能导致月经不规律、容易出汗等。闹铃还会影响到人的情绪，使人惊醒后精神亢奋。长期如此，还容易使人焦虑、注意力不集中、压抑甚至失眠。
最好将铃声设置为节奏较慢、音律舒缓的音乐，而且声音不能太大。另外，闹铃不要放在枕头旁或下面，要放在距离枕头1米的低矮家具上。专家还特别指出，不要用手机做闹铃，因为除上述引发的问题外，美国一项最新研究还指出，手机做闹铃会增大辐射强度。
