在夜晚的后半段，身体常规的生理机能并没有调整好。这意味着血压、心率和呼吸的波动比通常情况更极端。还有一个原因是身体平躺着，处于相对静止的状态，血液有些变浓，并伴随着一定程度的血液凝结。起床的动作也有可能导致问题，因为通常那时血压水平会发生大的振荡，加之还有突如其来干脆响亮的闹铃声，有时身体就应付不过来。
闹铃声也会增加你全面的压力水平。突然的噪声会引起身体保护性的条件反射——“战斗或逃跑”，提高肾上腺素水平。专门研究如何处理这种疾病的马克。阿特金森医生认为，虽然床头钟可能对你按时上班会有好处，但如果这种被激活的状态持续数天、数周、数月，就将导致慢性压力。压力会带来高血压、睡眠问题和精神压抑。如果你在深度睡眠时突然被唤醒，你思考问题的能力无疑将受到严重影响以至于就像喝醉了酒。
科学家们发现，当处于熟睡的人被唤醒时，会影响其短期的记忆能力、认知能力甚至是计算技能。这一发现已经被刊登在《美国医学会》杂志上。
