另一种方法是熄灭锅底下燃烧的柴火，即“釜底抽薪”法，这是治疗乙肝的根本方法。其目的是彻底清除盘踞在体内的乙肝病毒，使其无法复制和捣乱破坏。与“扬汤止沸”法相比，这种疗法难度大，任务重，目前尚有不少难题有待攻克。经过长期的努力研究，目前我国已生产出一些行之有效的药物，虽然不是立竿见影，但可称得上初见成效。这些药物可使乙肝病毒的主要检验指标，如乙肝病毒脱氧核糖核酸（hb-vdna）、乙肝病毒e抗原（hbeag）的转阴率达30%左右。也就是说，现在抗病毒治疗的效果已达到了暂时反应和部分反应水平，尚未达到完全反应水平。
目前较为公认的抗病毒药物有1.干扰素类，如重组a-2a干扰素、a-1b干扰素、a-2b干扰素等。2.核苷类抗病毒药物，如拉咪呋啶、无环鸟苷等。3.阿糖腺苷与单磷酸阿糖腺苷类。4.干扰素诱导药物。另外，基因疗法、导向疗法等尚处在研究阶段。就目前的乙肝治疗情况来看，“扬汤止沸”法仍占主导地位。一是因为它收效较快，立竿见影，用药适当时，升高的转氨酶或胆红素可迅速下降。二是相对来说，这些对症疗法花钱少，病人易于承受。三是目前“釜底抽薪”式的抗病毒治疗不仅药物价格昂贵，疗效也不显著。但我们还是主张采取“扬汤止沸”法和“釜底抽薪”法双管齐下的综合治疗，以便收到较好的疗效。
