病毒感染
病毒感染是诱发儿童与青少年睾丸萎缩最为常见的病因，尤其是流行性腮腺炎病毒，俗称痄腮病。当睾丸受此病毒侵袭后，睾丸内的生精组织会受到破坏，睾丸体积缩小，质地变软。
损伤或撞击
损伤阴囊或睾丸部位发生过撞击性损伤，造成阴囊血肿或睾丸裂伤等，即使创伤愈合，睾丸也会长期处于供血不充裕状态，发生萎缩。
炎症重度睾丸炎
发病时睾丸肿胀、疼痛，可以持续多日。
由于细菌侵犯而造成睾丸组织破坏，导致睾丸组织发生萎缩。
放射性物质影响
凡是较长时间接触放射性物质者，例如长期从事x线、同位素等职业人员，如未作很好保护，会引起睾丸萎缩症。
