灭菌治疗前的hp感染情况检测对于已行hp根除治疗的患者是否有必要再次检测感染情况仍未定论。一方面它可确认抗感染效果并进一步增强治疗信心，另一方面基于现有医疗条件下较高的灭菌率，再检测很可能是不必要的。但是，在治疗后如症状复发，则应再进行一次检测，若证实仍存在hp感染，可再次实行不同的hp根除治疗方案。
检测的敏感性及特异性不足会直接导致治疗不当。在hp感染率较低地区可能会出现假阳性，相反，在感染流行区则可出现假阴性。高阴性率同样具有重要性，因为患者会考虑到无需再次接受检测，检出结果阴性的患者可借此增强治疗信心。一般应采用尿素13c呼吸试验、粪便检测、敏感性及特异性均大于90%的局部血清检测来评估hp的感染情况。
对hp阴性及灭菌治疗后症状未缓解者的治疗hp检测治疗策略是未检出hp患者进行有效治疗的根本需要，而且鉴于临床上已将gerd排除，则可把此类患者归于功能性消化不良。此外，据orchid和ocay研究显示，功能性消化不良患者中有相当部分人在成功进行hp根除治疗后仍有不适并同样需要积极治疗（如前所述，假设这些患者在行hp根除治疗后均再次检测了hp）。
