婴儿湿疹病因比较复杂，有先天的体质因素，有些孩子属过敏体质，对所接触的毛织品、灰尘或食物（如牛奶、鱼、蛋）等过敏。也有后天营养失调、营养过多、消化不良、衣着不当，室内空气污浊，湿热，外部剌激等都是本病的诱发因素。患者常是先天性过敏体质，约有3/4的患者的父母双方或单有过敏性疾病病史。如不注意湿疹可长期反复发作或不愈。
大约20%的婴儿会对奶蛋白产生不同程度的不耐受现象，常表现为不同程度的湿疹，严重者可出现腹泻，甚至便血。一般婴儿只是对牛奶蛋白不耐受，但个别孩子对母乳蛋白也不耐受。这种不耐受表现多于生后1～2月开始，逐渐加重。生后4个月左右往往达到高峰。随着辅食的添加，情况多开始好转，一般2岁左右逐渐消失。但有些孩子皮疹会越来越重，今后出现食物过敏、过敏性鼻炎，甚至过敏性哮喘。
由于症状时轻时重，还有其瘙痒性常令家长烦恼，其实婴儿湿疹大多数可自愈，只有少数迟迟不愈而迁延到幼儿期或儿童期。因此，家长对婴儿湿疹不必过度紧张。很多家长应明白该病易反复，不要苛求一次性治愈，配合医生把婴儿湿疹控制在最轻的状态，帮助孩子顺利度过婴儿期。
