前列腺体表面有一层脂质包膜，细菌性前列腺炎因细菌引起炎症刺激，前列腺腺体包膜增厚，许多药括抗生素很难弥散到腺体内发挥治疗作用，因而腺体内达不到有效的抑菌，难以抑杀致病微生物，治疗上比较困难，治愈停药后常易再，故疗效较差。此外，前列腺炎并非皆为细菌感染所致，用抗生素治疗也不一定都有效。
在选择抗生素方面，早在20世纪80年代初国外医生就介绍，进入前列腺液中的抗生素可分为高水平、中等水平和低水平，其中高水平组内有三甲氧苄嘧啶、氯林霉素、红霉素等药。中等水平组内有氯霉素、林可霉素等药。其他为低水平的抗生素。20多年过去了，对选择药物进人前列腺又有了新的标准和原则。
一般来说，药物要能穿透前列腺上皮包膜而形成前列腺内有效治疗浓度者，需要遵循一些选择和应用原则。
