幽门胃腔通向十二指肠球部的门户，正常为圆形、应规律开闭的蠕动着，主要观察有否狭窄、变形或是长久开启，闭合不全状态，往往可见黄色胆汁液由门内返流回胃腔。如有溃疡样改变（幽门管溃疡）如有狭窄变形，应考虑是反复溃疡发作形成多个瘢痕致使其变形或幽门管癌等。
十二指肠球部过幽门，十二指肠的起始部位，呈圆形。观察黏膜是否光滑、如不光滑、弥漫性小颗粒状（淋巴滤泡增生）、发红（充血）、水肿、糜烂等改变多为十二指肠球炎。如有隆起样改变多为息肉、平滑肌瘤或癌症。
如有凹陷样病变多为憩室。在临床上溃疡样改变更多见，称十二指肠球部溃疡，同样分活动期（a期）、愈合期（h期）及瘢痕期（s期），如反复多次发生，由于瘢痕形成致使十二指肠球部变形，幽门狭窄而形成梗阻。
胃镜报告单上往往有对幽门螺杆菌（hp）的描述，hp为胃内感染性细菌，其是消化道溃疡病、胃淋巴瘤及重度慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生，不典型性增生而癌变的主要致病因素。因此在作胃镜时往往同时取活检，通过快速尿素酶试验，十分钟即可知道有否hp感染，阳性（+）为有、阴性（-）为无，从而可指导临床医生进行相应的治疗。
