我国自1982年制定并实施普种a群流脑多糖疫苗的综合防治措施以来，且随着人们居住条件和卫生状况的不断改善，我国流脑发病率逐年下降，至2000年以后，发病率下降到0.2/10万以下。
婴幼儿发病最高、其次为学龄儿童及青少年，大规模接种疫苗的地区，成人发病较高。流脑的高发季节为冬春季节。
人群发病易感性较低，感染后往往表现为局部粘膜感染，而无临床症状，为无症状携带状态，只有不到1%的人会出现临床症状。健康人群中携带病菌的比例在10-20%之间，流行时携带比例会更高一些。
脑膜炎是脑膜炎奈瑟氏菌感染最常见的临床表现形式，发病潜伏期为2-10天，平均4天左右。临床表现主要有急性发热、剧烈头痛、恶心、呕吐、颈强直、畏光、皮肤瘀斑等。本病病死率较高，过去在50%以上，目前由于抗生素的应用、医疗救治水平的提高，病死率已大幅度下降，但仍维持在8-15%的较高水平。另外10-20%的存活者将长期留有后遗症，如智力障碍、听力损伤等。
流脑通过呼吸道传播，传染源主要是健康携带者。本病传染性较低，如仅有3-4%的家庭会出现二代病例，而且大部分仅有1例二代病例。病菌对抗生素敏感，一般开始抗生素治疗24小时后，就不再有传染性。
