一部分被吸收入血还可以协同消除尿道等其它部位的感染。前列腺直接注射法的缺点首先在于前列腺位于会阴的深部，膀胱的下方，从体外将注射针穿人前列腺并非易事，而且，由于前列腺的位置深在，穿刺还容易引起局部损伤，出现血尿等合并症。其次，从体外经皮肤、尤其经直肠粘膜穿刺，容易带入细菌，反而可以引起前列腺或前列腺周围的感染。
再次，直接穿刺法穿刺和注药操作均可产生疼痛不适，而且多需反复多次穿刺，许多患者难以忍耐。最为严重的问题是，反复多次地直接注药会引起前列腺体的纤维组织增生和硬化，医生给这类患者作直肠指检时多可以摸到一个质地坚硬的前列腺。
众所周知，慢性前列腺炎是个复发性疾病，即使这次治愈了，在人体过劳、感冒、熬夜等抵抗力低下时有可能再次发作，这正像儿童的扁桃体可以发炎——痊愈——再复发的情况一样。这样，一旦慢性前列腺炎再次发作，由于纤维结缔组织的增生和对病灶的包绕，无论采用哪种治疗手段，药物都将更难进入病灶中发挥作用。因此，笔者认为，决定采取直接注射疗法应该慎重，除非包括药物离子导入疗法的各种治疗方法均效果不佳时，再考虑使用此法比较恰当。
