遗传因素5%的先心病患者发生于同一家族，其病种相同或近似可能由于基因异常或染色体畸变所致。
其他因素高原地区，动脉导管未闭及房间隔缺损发病率较高。原因可能与缺氧有关，有些先心病有性别倾向性。
特别告诫
预防可采取以下措施居住环境应空气新鲜、阳光充足，严禁接触放射性物质，避免在空气污染较重的环境中工作和生活。在妊娠早期积极预防风疹、流感等风疹病毒性疾病。食用新鲜蔬菜要用清水多次浸泡，以减少残余农药。不吸烟、不饮酒。
家长如何早期发现先心病
小儿莫名体质差应筛查先心病。何提醒，先心病常见而又不易被家属发现。常见的有三种类型室间隔缺损型、房间隔缺损型、动脉导管未闭型。大部分先心病在3岁前即可确诊，这些婴儿会有明显的心脏病症状，易出现气促、呼吸困难、多汗、生长明显落后及反复的肺部感染。但是，也有部分轻型患儿没有特异症状，直到长大成人都未能发现确诊，这时已出现严重心衰及器质性肺动脉高压，错过手术和最佳治疗机会。
家长如果发现孩子有上述症状但又没有其他明确病因，建议做个心脏彩超筛查一下。先心病如果发展到心衰及器质性肺动脉高压阶段，治疗是没有好办法的，这时心脏及肺血管的损害已不可逆转。但是，如果能早发现、早治疗，绝大部分心脏病是可以完全根治的。
