大约65%的女性偏头痛患者其头痛发作与月经周期有关，大部分月经期头痛加重，每月发作1次或1次以上，或月经期发作，或月经前1～7天发作，或月经后1～2天发作，即为月经性偏头痛。狭义的月经性偏头痛指患者头痛发作只在月经期发生，其他时间不出现头痛。月经性偏头痛往往有家族遗传史，它是一种与卵巢周期变化有关的特殊类型偏头痛。
研究认为女性体内雌激素水平的降低可引起偏头痛的发生，此时若补充雌激素可以控制和预防偏头痛的发生。雌激素水平下降的黄体期末和卵泡前期，偏头痛发作次数明显增多，在雌激素上升各期发作次数则减少，说明雌激素水平升高对抵抗偏头痛的发作具有保护作用。
而中医对此称为经行头痛，即逢行经前后和经期，出现以头痛为主症者，称为经行头痛。中医辨证分型为血虚头痛者，即经期或经后头晕头痛，心悸少寐，神疲乏力，舌淡苔薄，脉虚细。
