传统上，pe被认为是心理和人际关系的基础，在很大程度上是由于焦虑或调节的基础上对快速射精冲动早期的性经验。但随着神经生物学和遗传学的发展，对早泄的病因有了一定的新的认识。早泄的神经生物学方面，5-羟色氨酸调节异常作为先天性早泄的假设病因，被认为仅能用来向早泄人群中很小的一部分（2—5%）做出解释。早泄的遗传学方面，目前的证据表明，个体的基因多态性可能对射精延迟有微小的影响，伴有大量的遗传变异的男性可能倾向于患有早泄，但仍缺乏相关数据或存有争议。
对特殊患者人群的风险因素研究中也有所发现。
1.在对甲状腺激素的研究中发现，甲状腺功能亢进症（一种获得性疾病）对于原发性早泄没有作用，但在极其少的病人中被发现与继发性早泄有联系。在对其他激素的研究中发现，低催乳素血症和较高的睾酮水平不被认为是继发性早泄的病因。激素水平异常和早泄之间的关系还不明确。
