卫生间的环境问题主要有两方面
一是通风。高层建筑的卫生间排气道一般都比较狭窄，自然通风的效果差。一旦遇到无风、逆温天气，卫生间里的异味很难排到室外，甚至扩散到室内，污染室内空气环境。
家里收拾得干干净净，厕所擦得一尘不染，在马桶的一边，却有一个堆放废物的废纸篓，这种现象在不少家庭都司空见惯……厕所里放废纸篓不利健康。
二是防潮。很少有卫生间设计在朝南的阳面位置，而且多数没有窗户，采光不好，加上不能充分与外界空气进行交换，极易使细菌、真菌滋生和繁殖。
真菌是吸入性为主的变应原，能引起呼吸道过敏。轻者会鼻咽发痒、打喷嚏。重者会出现呼吸困难、哮喘不止等症状。个别人还会因此导致荨麻疹以及流泪、眼周围红肿等眼部过敏症状。在室内环境污染与人体健康调查中，有许多居民出现上述症状，却不知是由于卫生间太潮所致。
