正常情况下，受精卵移入子宫后，多在子宫侧壁或后壁着床。但对纵隔子宫畸形者，纵隔为子宫腔内的凸起部分，在受精卵进入宫腔后，易在凸起的纵隔区域内膜上着床。因纵隔组织与正常子宫壁组织不同，其结缔组织成分多于平滑肌成分，含有较多的胶原成分，血管又比较少，如果胚胎着床于此，可因为纵隔区域血运差，纵隔内膜发育不良，致使种植于该处的胎盘缺血而影响胎儿正常发育，容易导致胚胎停止发育，出现反复流产或胎儿死亡。
林某，结婚6年，肚子仍然没有一点动静。她自我感觉身体没有任何异常。婚后不久，她也看过医生，b超检查提示纵隔子宫，其他情况都正常。医生说纵隔子宫常见，是小问题，能正常生育，不用治疗。可6年过去了，她这个在婆婆眼里“不会下蛋的母鸡”最近一次去医院做检查时，查出子宫腔呈典型的“马鞍型”改变，诊断为“不完全性纵隔子宫”。
子宫纵隔组织就像植入子宫腔内的异物，可阻止受精卵着床，甚至受精卵可能因此返流到输卵管着床，导致宫外孕;或者受精卵错过了最佳着床时间，可导致久婚不孕。
