男性生殖器畸形须注意。包皮过长和包茎、海绵体硬结症、隐匿阴茎等都属于市中区畸形，要时刻注意其变化。
包皮过长，包皮口狭小和包茎，会导致包皮垢和尿在包皮腔内积留，诱发阴茎头包皮炎，产生脓性分泌物及表皮脱落，严重者可引起包皮和阴茎头溃疡或结石形成，造成尿道外口狭窄，发生急性尿潴留。严重的阴茎外口狭窄会束缚阴茎的发育，影响生育。阴茎头包皮炎的反复发作，还可使患者变得情绪不宁和神经质。
中年患者易患阴茎硬结症，容易发展成隐伏的阴茎纤维性海绵体炎斑块，失去正常的弹性而出现阴茎弯曲。一旦勃起不仅疼痛且会弯曲变形，影响正常性生活，甚至引起阳萎。当勃起时阴茎弯曲变形持续1年以上或斑块钙化者，应当及早手术。
阴茎阴囊转位，常并发尿道下裂。尿道下裂是常见的尿道和外生殖器畸形，严重的需进行染色体检查和性腺检查，通过手术重建尿道，以获得完整的外生殖器。
阴茎扭转，即阴茎头偏离中线，严重的患者有碍性生活，有时会导致患者无法正常自立排尿。还会影响患者健康性心理的形成，影响正常的社交活动。
