畸形精子症是正常形态的精子少于50%，即精子中畸形精子超过50%。畸形精子是指头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等;体部畸形有体部粗大、折裂、不完整等;尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。
引起畸形精子症的原因有泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等，它们均可影响精子的质量;使用激素或某些化学药物，如抗癌药、利血平、呋喃类等，可使精子发育不成熟;生殖腺受到放射线照射，可引起精子的突变;阴囊局部长期高热、长期酗酒（特别是高浓度的烈性酒），均可使精子发生畸变。畸形精子超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，治疗则比较困难。
精子培养发现有支原体感染时，精子活力降低，精子密度减少，畸形精子增多，可服用强力霉素，首次服用200毫克，以后每日100毫克，连服2周，可恢复生育。
