当精子异常的时候，应该考虑有没有一些相关的疾病，这对于确立诊断是非常重要的，这也是提高治疗效果的唯一途径。常见的导致精子异常的疾病因素有以下几点：
1.性传播性疾病引起精子异常
在整个人群中，患有性传播性疾病与未患此病者的无精子症发生率相似，但是前者精子分析异常发生率显著较高。性传播性疾病似乎不影响精子密度，说明不会引起输精管道狭窄或堵塞。性传播性疾病者一般表现在精子活动率下降，这与附性腺功能的紊乱特别是与附睾炎 有关。不可忽视的是，解脲支原体、沙眼衣原体感染在临床上也是很常见的，而且这些感染并没有显著的症状，更有一定的隐蔽性。
2.腮腺炎
青春期前后发生腮腺炎，并不会引起无精子症的发生率增加，但是伴有较高的异常精子的可能性。青春期后发病者精子密度明显低于未发病者或青春期前发病者。腮腺炎病人中仅有4.4%合并有睾丸炎 。青春期前患病者很少合并睾丸炎，但是青春期后患病则可以发生。睾丸炎显著影响精子质量，增加无精子症的发病率，特别是双侧睾丸炎。无论是单侧或双侧睾丸炎，精子分析异常者增加。总之，腮腺炎特别是合并睾丸炎时，对生育会产生不良的影响。
