服用紧急避孕药有时可引起一些轻度的副作用：例如恶心、呕吐、头痛、头昏、腹痛、乳房胀痛。这些副作用一般在24小时内消失。
1、恶心：用紧急避孕药的女性恶心发生率最高，约为50%;左炔诺孕酮次之，约为20%;米非司酮最低，约6%～7%。恶心一般持续不超过24小时
2、呕吐：左炔诺孕酮约5%：米非司酮约1%，与食物同时服用或睡觉前服药可以减少恶心、呕吐的发生率。如果在口服紧急避孕药后1小时内呕吐，应该尽快补服1次。
3、不规则子宫出血：有些女性用药后会有些x点滴出血。一般无须处理，但要让用药者了解此种情况。做好用药前后的咨询、宣教。
4、月经改变：多数妇女月经会按时来潮，也有一部分妇女月经提前或延迟。如果月经延迟一周，应该做尿妊娠试验，以明确是否是紧急避孕失败。
5、其他：乳房胀痛、头痛、头晕、乏力等，这些症状一般较轻微。持续时间不超过24小时。乳房胀痛、头痛严重者可用阿斯匹林或其他止痛药对症处理，
需要强调的是，由于服用紧急避孕药，会影响月经周期，因而在随后的几个月中计算安全期会有所障碍，女性在此之后尽量使用效率高的避孕方法，而不要再冒险、严重的会导致不育。
