隐形眼镜镜片与眼药水直接接触，可能吸收药中的防腐剂。现在市面上的大多数隐形眼镜是水凝胶成分的，它的骨架结构吸收有水分子，眼药水中的药物和防腐剂成分可被吸收至镜片中，改变镜片的透光率、离子性等物理特性，影响镜片的矫正效果。另外，防腐剂在镜片中积聚，长期刺激眼睛，容易引起过敏反应。
水凝胶材料的软性隐形眼镜其透氧性低，长时间戴容易引起角膜上皮水肿。眼药水往往是眼部有疾病时才使用的，这时候再戴水凝胶材料的隐形眼镜，会加重眼表负担，尤其是患流行性出血性结膜炎（俗称“红眼病”）时，建议您停戴隐形眼镜。
有些眼药水，如利福平滴眼液，本身就是棕红色的，用后可使镜片着色，影响透光率和屈光度数。
现在市面上有配好的隐形眼镜专用润眼液，其成分已经考虑了镜片的材料、含水量等物理特性，可以在戴隐形眼镜期间使用。平时有戴隐形眼镜习惯的人，最好将戴水凝胶材质镜片的时间控制在6—8小时内。如因为特殊需要，必须在使用隐形眼镜的同时滴眼药水，建议先点眼药水，过15—20分钟待眼表的药物基本吸收时，再戴隐形眼镜，并且每次戴的时间不宜过长。
