吸烟会诱导基因突变
配子形成及发育很容易受到烟草的损伤。烟草烟会损伤人生殖细胞染色体及dna。孕妇吸烟会增加后代21三体的风险，原因在于母体减数分裂过程中（染色体）不分离，烟草烟中的毒性氧自由基（ors）能促使dna复合物的形成，从而诱导产生突变。dna损伤是理解吸烟损害生殖功能的基础，如增加流产，加快绝经的出现以及降低生育能力。
吸烟会引发流产
吸烟会增加自然及辅助周期妊娠的自然流产率。吸烟导致流产的机制尚不完全清楚。有报道认为与吸烟对孕产物组织染色体的影响有关。此外，烟草烟中的物质成分如尼古丁、一氧化碳及氰化物的血管收缩和抗代谢特性可能导致胎盘功能不全、胚胎或胎儿生长迟缓以及死亡。
母亲吸烟对男性子代会产生影响
母亲吸烟会影响男性后代精子数量，母亲每天吸烟多于10支，儿子精子密度低于母亲不吸烟的男性。
