治疗黄素囊肿一般不需处理，而应严密随诊观察，多半可自行消失。有不规则子宫出血者可按功能失调性子宫出血治疗。因其他原因进行剖腹手术中发现单侧单发、囊壁发黄的卵巢囊肿时，应结合有无妊娠可能而考虑是否黄体囊肿或其他囊肿，在排除妊娠而又不能肯定诊断时，可行囊肿剜除术。
当黄素囊肿发生扭转时，应及时剖腹探察，因扭转后多数发生血运障碍，故需患侧附件切除术。对于囊肿破裂内出血不多，无休克，也不再继续出血者，可行保守观察，并给予中药促使内出血吸收。当内出血较多，或出现休克者，宜紧急剖腹探察，制止出血，纠正贫血。对于破裂囊肿的去留，视破裂程度与患者年龄。年轻、破口损伤简单，可考虑破口修剪缝合，或行囊肿挖除后卵巢成形术。
