很多人也很关心关于童子尿入药治病的问题。唐代名医孟诜在其所著的《必效方》中记载了童子尿治疗骨蒸发热的方法“三岁童便五升，以蜜三匙和之，每服二碗，半日更服。”在古代医案中还有不少类似记载。主要用法有煎煮后饮用、与药同煎服、作酒服、送药饮等。即使直接饮用也有讲究，比如清代《重庆堂随笔》记载“童子小便，最是滋阴降火妙品，故为血证要药。必用童子者，尤须淡泊滋味，不食荤颤，去其头尾，但以中间一段清澈如水始有功效。”
要注意的是，虽然古书关于童子尿记载较多，但其疗效并未得到现代医学验证，在临床上已经基本不用了。
