医生可以通过子宫内膜活组织切片检查较为精确地诊断出激素分泌失调的病症，这种检查通常在一个月经周期末尾的时候进行。治疗的方法一般是服用药物，改善卵子发育的状况，进而改善激素的分泌。
子宫病症
子宫内部组织的问题也可能导致流产，而女性通常到了怀孕的时候才会发现这些问题。子宫肌瘤就是元凶之一。大多数子宫肌瘤长在子宫外壁上，因而不会对怀孕造成什么威胁。但是那些长在子宫内的肌瘤则会抢占胚胎发育所需的空间，并且影响到胚胎的血液供应。另一种可能影响怀孕的子宫疾病出在隔膜上，它将阻止卵子正确着床，并且阻断流向胎盘的血液。宫颈无力也是导致流产的原因之一，由于宫颈缺乏力度有可能无法承受发育中的胎儿的重量。许多宫颈无力的孕妇在怀孕后的头3个月里不会出现什么症状，但是4至6个月期间就有可能流产。
慢性病
在怀孕期间保持良好的健康状况是至关重要的，但是对于患有慢性病的女性来说做到这一点很困难。习惯性流产中有6%是由严重的糖尿病、甲状腺分泌失调或是心脏、肾脏、肝脏疾病等引起的。但是母体健康状况不佳并不意味着无法养育健康的宝宝。患有慢性病的孕妇可以在有经验的产科医生的指导和监控下正常分娩。
