很多人喜欢选棉布的马桶垫，认为棉布亲肤舒适，但是棉布最容易孳生细菌，以及一些化纤材料，也都不适合做马桶垫。
选马桶垫看质感
此外，为了舒适的考虑，最好选较厚实坚硬，并且较高的马桶垫，这样可以让马桶感觉更平整易于用力，排便更加舒适。软而光滑的马桶垫则容易使人坐上去的时候发生滑动，且会塌陷下去，很不舒适。
此外，如果皮肤直接和坐便器接触，容易传染例如疥疮、毛囊炎、体癣、股癣、疣类皮肤病等。
据吴军对于部分过敏体质的人来说，在接触新漆马桶时，容易导致臀部皮肤出现丘疹、水疱、瘙痒等症状。
这是接触皮炎中的一种，因与接触马桶有关，临床上通常称为“马桶癣”。
